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DAP-seq

簡要描述:轉(zhuǎn)錄調(diào)控-DAP-seq
100+物種,2000+轉(zhuǎn)錄因子的實(shí)戰(zhàn)經(jīng)驗(yàn)。
無需抗體,高通量鑒定轉(zhuǎn)錄因子的下游基因,藍(lán)景科信已助力客戶在許多期刊發(fā)表文章,例如:Molecular Plant,The Plant Cell,Plant Physiology,Plant Biotechnology Journal,Journal of Integrative Plant Biology,New Phyto

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  • 廠商性質(zhì):生產(chǎn)廠家
  • 更新時(shí)間:2024-06-28
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DAP-seq:轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)研究新方法(DNA親和純化測序)

在功能基因組學(xué)和表觀遺傳學(xué)研究中,轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)(TFBS)的發(fā)掘一直是研究熱點(diǎn)。傳統(tǒng)的ChIP-seq(染色質(zhì)免疫共沉淀測序)方法,在抗體質(zhì)量很好的情況下能夠有效檢測到TFBS。然而,好的抗體可遇不可求,這限制了ChIP-seq更廣泛的應(yīng)用。

 

DAP-seq技術(shù)的出現(xiàn),使TFBS 的研究不再局限于物種,不再受抗體質(zhì)量的限制,為生命科學(xué)領(lǐng)域轉(zhuǎn)錄因子的研究提供了新的有效工具。

 

DAP-seq具有與ChIP-seq同樣的功能。通過體外蛋白表達(dá)技術(shù),表達(dá)出帶有標(biāo)簽的轉(zhuǎn)錄因子,和基因組DNA文庫在體外進(jìn)行結(jié)合,然后分離出所有與轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合的DNA,再使用高通量測序,找到轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)合位點(diǎn)。


藍(lán)景科信為您提供DAP-seq全流程技術(shù)服務(wù)和個(gè)性化數(shù)據(jù)分析,具有100多個(gè)物種,2000多個(gè)轉(zhuǎn)錄因子的實(shí)戰(zhàn)經(jīng)驗(yàn)。歡迎咨詢。

DAP-seq

服務(wù)內(nèi)容:

服務(wù)項(xiàng)目 周期 交付結(jié)果
蛋白表達(dá)載體構(gòu)建 1-2周

構(gòu)建載體的測序結(jié)果

實(shí)驗(yàn)過程圖

原始測序數(shù)據(jù)

分析結(jié)果

蛋白無細(xì)胞表達(dá) 1-2周
DAP-seq文庫構(gòu)建 1周
DNA親和純化 1-2周
上機(jī)測序 2周
標(biāo)準(zhǔn)數(shù)據(jù)分析 2周

       



已做物種:

植物

擬南芥

莖瘤芥

甘藍(lán)型油菜

白菜型油菜

不結(jié)球白菜

菜心

小麥

大麥

花生

辣椒

番茄

草莓

黃花棘豆

苦蕎

紅薯

木薯

馬鈴薯

普通煙草

人參

鴨茅

罌su

甘蔗

短芒大麥草

二色補(bǔ)血草

煙草

百脈根

芍藥

丹參

狗尾草

菠菜

玉米

大豆

高粱

藜麥

陸地棉

甜瓜

黃瓜

葡萄

灰氈毛忍冬

粉葛

三葉青

獼猴桃

香蕉

蒺藜苜蓿

紫花苜蓿

伴礦景天

苔蘚

地錢

毛果楊

717

84K

小黑楊

胡楊

山新楊

小葉楊

歐美楊

大青楊

毛白楊

剛毛檉柳

白樺

光皮樺

油松

毛竹

麻竹

銀杏

油桐

荔枝

柑橘

甜橙

歐洲云杉

核桃

柿子

閩楠

木荷

臍橙

板栗

杜梨

蘋果

櫻桃

麻瘋樹

茶樹

月季

海島棉

白木香

橡膠樹

三角褐指藻

芥藍(lán)

藍(lán)花耬斗菜

鹽芥

無花果

菠蘿

西瓜

甘薯

竹葉花椒

玫瑰

 

動(dòng)物

飛蝗

新孢子蟲

煙粉虱

草地貪夜蛾

 

真菌

擬輪枝鐮孢菌

豬苓真菌

意大利青霉

草酸青霉

腐霉

金黃殼囊孢

靈芝

糙皮側(cè)耳

草菇

灰蓋鬼傘

蟲草

亞洲鐮刀菌

蝗綠僵菌

 

 

細(xì)菌

路德維希腸桿菌

嗜熱厭氧桿菌

生氮假單胞菌

伯克赫爾德氏菌

布魯氏菌

肺炎克雷伯菌

 

     

 

 

 

 

 







相關(guān)服務(wù):

1、 凝膠阻滯實(shí)驗(yàn)(EMSA):DAP-seq后續(xù)驗(yàn)證服務(wù)。
2、 酵母單雜交:DAP-seq后續(xù)驗(yàn)證服務(wù)
3、 ChIP-seq:高效檢測重組蛋白、轉(zhuǎn)錄因子在基因組的結(jié)合位點(diǎn)
4、 DAP-seq與RNA-seq聯(lián)合分析: 分析轉(zhuǎn)錄因子的靶基因在RNA-seq數(shù)據(jù)中的表達(dá)變化,深入挖掘DAP-seq和RNA-seq測序數(shù)據(jù),增加轉(zhuǎn)錄組測序的分析深度。
5、 DNA-pull down:鑒定與DNA結(jié)合的蛋白。
6、 精美的論文圖片設(shè)計(jì)與制作:專業(yè)設(shè)計(jì)師,設(shè)計(jì)精美論文插圖,提升論文的嚴(yán)謹(jǐn)性和美觀度。

DAP-seq:轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)研究新方法
DAP-seq是基于DNA親和純化,通過體外表達(dá)轉(zhuǎn)錄因子鑒定TFBS的技術(shù),具有不受抗體和物種限制,且高通量的優(yōu)勢(shì),自該技術(shù)問世以來,已被廣泛應(yīng)用于轉(zhuǎn)錄調(diào)控和表觀組學(xué)的研究。能幫助您快速找到轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)合位點(diǎn),尋找轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控的靶基因。

 

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